La Universidad de Granada (UGR) será el escenario de la celebración, los días 20 y 21 de febrero de 2024, de las VIII Jornadas de Bioinformática. Esta cita, de carácter gratuito y plazas limitadas, tiene el objetivo de, a través de las diferentes ponencias programadas, ofrecer una visión general de esta disciplina, incluyendo ejemplos de las aplicaciones prácticas de la informática dentro del área de la Biociencia y la Biomedicina (neurociencias y enfermedades complejas, genética y epigenética, diagnóstico molecular...), que están permitiendo explotar de manera más eficiente los datos biomédicos y generando oportunidades de innovación y mejora de la salud global.
Esta cita, que se desarrollará en modalidad dual (presencial y online) y será emitida a través de la plataforma YouTube, ofrece a los participantes 25 horas de formación, de las que 10 estarán conformadas por diferentes ponencias y las 15 restantes serán para talleres. La idea es que no sea sólo un simple acto de divulgación científica, a pesar de contar con la presencia de ponentes con una amplia relevancia internacional, sino también un foro de orientación profesional y empresarial, realizando una clara apuesta por el emprendimiento.
Además de las ponencias, orientadas especialmente al alumnado y profesorado de los grados de Biología, Bioquímica, Biotecnología e Informática, y los talleres, para los que será necesario disponer de cierta formación sobre computación, las Jornadas contarán con una competición 'Datathon', en colaboración con la Unidad de Bioinformática del Centro de Genómica e Investigación Oncológica (GENYO) y la empresa internacional Revvity.
Programa
Las jornadas están organizadas por el Departamento de Ciencias de la Computación e Inteligencia Artificial, el Vicerrectorado de Extensión Universitaria de la UGR, Consejería de Universidad, Investigación e Innovación de la Junta de Andalucía a través del Programa Qualifica (QUAL21-14), FEDER, Unión Europea - NextGenerationEU y el Instituto de Salud Carlos III (proyectos PI20/00711 y PI23/00129). Los participantes obtendrán un Certificado de asistencia si, tras inscribirse en las Jornadas (estará abierta hasta el 13:00 del martes 20 de febrero de 2024), asisten a las dos sesiones programadas y completan un breve cuestionario de satisfacción.
- Ponencias
- Martes 20 de febrero
- 16:00 - 16:30 Apertura (María del Carmen Carrión - Decana de la Facultad de Ciencias)
- 16:30 - 17:30 Traduciendo datos en oportunidades de innovación y mejora de la salud global (Juan Ramón González - ISGlobal)
- 17:30 - 18:30 El ejercicio como medicina y como opción académica y profesional (Jonatan Ruiz - Universidad de Granada)
- 18:30 - 19:00 Pausa
- 19:00 - 20:00 Inteligencia Artificial en la investigación cardiovascular (Fátima Sánchez - CNIC Madrid)
- 20:00 - 21:00 BioinfoGRX
- Miércoles 21 de febrero
- 16:00 - 17:00 La ciencia que no se cuenta no existe (Carlos Centeno - Director de Comunicación UGR)
- 17:00 - 18:00 De la informática a la biología: machine learning para datos biomédicos basados en imagen (Daniel Peralta - Ghent University)
- 18:00 - 18:30 Pausa
- 18:30 - 19:00 Mesa de empresas
- Revvity Signals, herramientas y plataformas para la ciencia
- Diseño de sondas basadas en PNA (peptide nucleic acids) para la cuantificación directa de RNAs mediante la tecnología dynamic chemistry labelling
- Q&A: Formación y perspectivas profesionales en Bio-Informática en España
- 19:00 - 20:00 Mesa redonda y clausura
- Martes 20 de febrero
- Talleres
El acceso a los talleres estará disponible, a través de la herramienta Google Classroom, para cualquier persona inscrita en las Jornadas. Los inscritos recibirán vía correo electrónico toda la información relativa a la participación en los talleres. Cada uno de los talleres supone, si se completa de manera correcta, la obtención de un certificado de 15 horas de formación online.- Una visión general del flujo de trabajo con Machine Learning para aplicaciones biológicas
- Alberto Fernández (Universidad de Granada)
- Aprende R para análisis de expresión de ARN
- Carlos Cano y Coral del Val (Universidad de Granada)
- Introducción a la aplicación de técnicas de regresión en R
- Rafael Alcalá y Augusto Anguita (Universidad de Granada)
- Una visión general del flujo de trabajo con Machine Learning para aplicaciones biológicas
- Datathon
Este concurso, organizado por los departamentos de Ciencias de la Computación e Inteligencia Artificial y de Estadística e I.O., junto con la Unidad de Bioinformática del Centro de Genómica e Investigación Oncológica (GENYO), premiará a las personas responsables de los dos mejores Trabajos Fin de Máster (TFM) sobre bioinformática defendidos entre el 1 de enero de 2023 y el 20 de febrero de 2024.
Ediciones anteriores
La primera edición de estas Jornadas se celebró los días 15 y 16 de febrero de 2017 y en ella se habló de los retos, oportunidades y perfiles profesionales demandados en el campo de la bioinformática. Se 'viajó' de la biomedicina a la bioinformática a través del epigenoma y se analizó el perfil genético en enfermedades complejas, lanzado la pregunta ¿mito o realidad? Otros temas analizados fueron Era7 bioinformatics, bioinformática y multidisciplinaridad; bioinformática y medicina de precisión; la bioinformática en el análisis epigenómico; y Bioinformática, mapa de oportunidades en la industria.
Un año más tarde, los días 14 y 15 de febrero, se habló sobre genética y epigenética en neurociencias; se volvió sobre el asunto de la bioinformática y las enfermedades complejas; y se profundizó en el diagnóstico molecular de enfermedades genéticas basado en técnicas de secuenciación masiva; en el análisis bioinformático de variación en número de copias; de la ecología sin pisar el campo, la revolución de la teledetección; y de la ciencia a la industria del software para conocer cómo un bioinformático termina trabajando en la empresa.
La edición de 2020 tuvo como asuntos más destacados un paseo por la Ciencia de Datos, herramientas y aplicaciones para Big Data en Bioinformática y Biomedicina; el análisis bioinformático de integración de datos para el estudio del cáncer; el uso de Deep Learning para la detección desde el espacio de ballenas y plantas; el proyecto de los 100.000 genomas desde dentro, uso clínico de la secuenciación masiva de genomas; modelando la naturaleza y Bioinformática aplicada al I+D en la industria farmaceútica.
Las IV Jornadas, desarrolladas los días 13 y 14 de febrero de 2020, estuvo centrada en analizar la integración de Datos Ómicos en Enfermedades Complejas; la comprensión de la heterogeneidad de las enfermedades a través de perfiles de expresión genética unicelular y masiva; el Screening de alto contenido: análisis, desafíos y perspectivas; las aplicaciones y desafíos de la bioinformática en oncología traslacional; la Inteligencia Artificial y Datos Ómicos al Servicio de la Medicina de Precisión; y hacia la Medicina Personalizada en el Sistema Andaluz de Salud.
La cita que se desarrolló en 2021 analizó asuntos como la Inteligencia Artificial y Medicina Personalizada: caminos convergentes; de matemáticas, biología y medicina: un viaje basado en datos; el abrazo del escutoide; personalizando las intervenciones terapéuticas en la era del big data y la inteligencia artificial; luces y sombras en análisis integrativo de datos ómicos; la investigación en biomedicina como ciencia de datos; PerkinElmer, una inmersión en una organización global de tecnología de ciencias biológicas; Centro de Excelencia en Ciencias de la Vida: innovación de la mano HPC, AI y Computación Cuántica.
Hace dos años, en 2022, las Jornadas se celebraron el 24 y 25 de febrero y tuvieron como asuntos de interés la presentación de la Sociedad Española de Bioinformática y Biología Computacional; los sistemas de bioimpresión 3D aplicados a la medicina regenerativa y las terapias avanzadas; el camino hacia la Bioinformática; Inteligencia Artificial para todos los públicos; entre la Bioinformática y la Biología Estructural, y como desde la interdisciplinaridad montamos Integromics S.L.; el procesamiento de datos en espectrometría de masas y Machine Learning como herramienta diagnóstica; y personalidad, creatividad e Inteligencia Artificial.
Y finalmente, la edición anterior a esta, la que se celebró los días 22 y 23 de febrero de 2023, los temas que se pusieron sobre la mesa fueron ¿puede la IA saber quién eres mirando tu interior?; Bioinformática vegetal: cosechar datos para fertilizar la investigación; enseñando biología a las máquinas a través de la semántica; la Inteligencia Artificial aplicada en Medicina, un cambio de Paradigma; estadística y Bioinformática, una simbiosis necesaria; y secuenciación de lecturas largas de molécula única para la caracterización del transcriptoma.